Codi SMILES

10Abr08

La paraula SMILES és un acrònim que ve de l’anglès i significa: Simplified Molecular Input Line Entry Specification i és una manera d’entrar en format text el que és l’estructura química d’una molècula utilitzant caràcters, tant siguin numèrics com alfabètics.

 

Exemples d’algunes de molècules amb enllaços simples, dobles(=) i triples (#):

• C representa el metà (CH4)
• O representa l’aigua (H2O)
• CCO representa l’etanol (CH3CH2OH)
• O=C=O representa el diòxid de carboni (CO2)
• C#C representa l’acetilè (HC≡CH)
• CC(=O)O representa a l’àcid acètic (CH3COOH)
• c1ccccc1 representa al benzè
• [C@2H]([OH])([C@2H]([OH])[C](=[O])[O-])[C](=[O])[OH] representa l’àcid tartàric

La següent web et permet fer la generació de gràfics de molècules en 2D a partir d’una cadena SMILES.

 

Cal dir però que l’any 2001 va aparèixer un nou codi anomenat Inchi. També és un altre acrònim anglès que significa: Identificador Químic Internacional (InChI). Treballa de manera similar al codi Smiles, però utilitzant un altre codi per designar l’estructura de les molècules.

 

A la següent web podeu trobar diferents programes que us permetran buscar els codis smiles de les diferents molècules, dibuixar molècules, passar estructures de 2D a 3D…(Anar)

 

Trobo que la utilització d’aquests codis és de gran ajuda ja que ens permeten anomenar una molècula, incloent-hi la seva estereoquímica, d’una manera molt senzilla.

Filed under: Uncategorized   |  Leave a Comment